台军不再提什么境外决战，所谓“本土防御”已成重中之重。台军认为“本土防御”之重点是反登陆作战。由于台军海空力量的不足，因为反登陆作战更多的依赖于台湾陆军。当时台空军订购的新生产的飞机尚没有出厂，作战部队只能以老旧的飞机临时代，加之又损失了大批有经验的飞行员，所以战斗力尚没有恢复战前的水平。失去空军的强力支援后，台海军也有力无处使用。为此，计划于战时将台陆军正规军扩充至200万，和平时期也不低于80万，以及大量准军事部队。由于陆军规模的扩大，台陆军进行了改编，以前的联兵旅全部升级为师，分为步兵师，机械化师，装甲师，炮兵师。
除增加陆军数量之外，台湾更谋求提高陆军的装备质量。基于对第二次朝鲜战争实战经验的总结，台军认为105毫米坦克炮对解放军装备的新式坦克已构不成威胁，决定为M60坦克换装120毫米坦克炮，所需的120毫米坦克炮自然由美国采购。美军借此机会为自已装备的M1坦克换装新生产的坦克炮，将拆下的旧坦克炮出售给台湾，名为处理“废旧物资”，实际收取的费用至少为新炮售价的3倍，可谓利润丰厚。旧120毫米坦克炮比新的贵本不合理，然而台湾还得接受，因为除此之外别无选择。除为M60坦克换装120毫米坦克炮外，别加装附加装甲板及反应装甲以加强其防护能力。虽然武器专家多认为改装过于急促，尚存在许多小问题，台湾军方还是决定将400辆M60坦克按此标准换装。原来从美国购进的M1A2坦克数量太少，而且不可能再增加，美国方面已保证不再向台湾出售新坦克，因此只能采用改装的M60坦克。
台湾还仿效解放军组建空中突击部队，将原有的3个陆航旅合编为一个陆航师，其番号为第100空突师。但是该师的人员与装备数量从没有过达到其编制的要求，各类装备的状态也不好。大多数直升机不仅性能达不到要求，而且老化问题严重。人员素质问题更为严重，直升机飞行员的素质较好，但缺少合格的指挥人才，其作战理论完全是照搬别人的东西，没有一点自已的东西，正如了解这支部队的美国军人所说：“这支部队不成熟！”
出于反登陆作战的需要，台军沿海岸线布置了大约30个步兵与守备师，并构筑起了大量工事，尤其是面向大陆地区的重点地区，组成一条沿海防线。台军虽然对外宣称沿海防线“固若金汤”，但心中从来没有这样想的，他们认为当前的情况下，要阻止解放军登上台湾岛根本不现实，因此作战重点是登陆场的争夺，实际反击将解放军赶下大海。为此，沿海岸线布置的多为二流部队，而精锐部队多布置于纵深地区，担任对登陆场的反击任务。
失去金门与马祖之后，澎湖已成台湾防防御的最前线，虽然停火协议中明确规定澎湖为不设防区，然而台军依然秘密将3000人的陆军人员改称警察驻扎于此，并强制性的将当地全部适于服役的居民编入预备役；禁止布置于澎湖的重装备秘密储备于当地的仓库之中。金门之战中被俘的沈光明回到台湾后，不久即被任命为澎湖守军司令，台军方对于他守卫金门的表现非常满意，认为他是担任澎湖守卫任务的最佳人选，原来台军方高层并不知道，金门的实施指挥官为李纱。金门之战的功臣李纱因私自下令守军投降，不得重用，仅被任命为一个师长，去指挥一个二流步兵师，该师人员全部是金门之战中被俘遣返回台的金门守军。这些遣返回台的官兵虽拥丰富的实战经验，但他们返台后，反战情绪很高，明显是受了大陆宣传的影响，让当局非常不放心，所以他们返台后多退伍返家，只有少部分被编入二流部队。
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