从自然进化论来说，人类社会都是因为各种思想、欲望的追求，而导致了弱肉强食的生存竞争。因此，吴雷川将进化的动力归结为人类思想，而不是物质性的因素。他说：“世界进化是以人类的思想为动机。”因为社会上一切组织制度，以及风俗习惯的改进，都赶不上思想的变化。如果一个人的思想经常都会有变化，当社会环境不能满足他的要求时，就自然会发生冲突，给他带来痛苦或苦恼，甚至使他失望。[18]同样，对于一个社会群体来讲，他们的思想也经常与社会的状态发生冲突，比较近代中国遭遇内外交困，许多青年人就不满足于现状，于是参加各种革命行动。“青年为什么要加入运动呢?大抵人生内心的思想，必不能与外面的环境一同静止，所以人类要求进化，总是继续不息的。中国自与各国通商立约以来，国势久已不振，现时国体虽改，然而政治的不良，交涉的失败，军队的专横，民生的困苦，年复一年，毫无进步，在这种状况之下，一般关心国事的人，或著书立说，痛切陈词，或居恒忧愤，咨嗟太息，青年学子，既已习见习问，一遇见事变当前，他们爱国的热诚，当然勃发而不能自已。”[19]
但是，世界的变迁和社会的进化所导致的许多弱肉强食的现象，也是人类的灾难，人类如何能够拯救自己的命运？吴雷川感叹道：
光明的生命啊!你有自然的原则，本是真实而普遍的。可惜一般人如同在镜子里看不清楚，就常常走入歧路。宇宙变迁，人群进化，到而今，自戕生命的事，还是不可胜数。怎怪人说世界恶浊，人生痛苦?[20]
吴雷川不得不求助于基督教来拯救人类的进化恶果。在他看来，人类的进化违背了基督教的进化之道。在这里，他不仅不否定社会进化思想，甚至还认为基督教中就有进化思想，而进化就是上帝的真理。他说：
人与上帝的生命是一同永久。人群进化是上帝的真理。他都一一证明。叫人照着他的道路去行。得着永久的生命。人群就自然本着真理一同进化。所以他说他就是道路真理生命。他称为基督，不是一时代的君王，乃是全人类的领袖。是以思想改造为起点，以践履笃实为终点。完全是他自力。是我们可以勉力效法的。所以我们信仰他，姑且不必说应当如何倚赖神权。欲可以说实实在在的能增进人格。[21]
吴雷川对进化思想的理解，其实更多的是一种变化发展的观念，而且在他看来，事物的变化发展就是由上帝决定的，因为上帝是全能的，哪有什么不是由他决定的呢？因此，他说：
耶稣曾说上帝作事直到如今，俨然是近代科学家承认宇宙只是一个动力的说法，也就是宇宙恒久进化的原理。惟其如此，所以他又曾说上帝凡事都能，有人以为说上帝是全能，是一种难以证明的悬拟，其实这正是不可磨灭的事实。因为人生不断的努力，终有成功的一日，自然界的演进更是这样。《中庸》所谓“故至诚无息，不息则久，久则征……悠久所以成物也”，正是这个道理。[22]
近代进化论强调遗传与环境对人的决定性影响，吴雷川也吸取这种思想，并将生存竞争看作对不良环境和遗传的抵抗或抗争，认为进化论的这种思想正是要人们勇敢地面对一切恶的事物，改变它们，而不能屈服于恶的事物。在他看来，这正是耶稣建立天国所遵循的上帝的旨意。他说：
遗传与环境的天然律，正是表明我们个人的行动，对于后嗣和人群，必有相当的影响，无可掩饰，也不容逃遁。所以耶稣建立天国，秘要各个人遵着上帝的旨意行。耶稣一生奋斗就是要显明上帝的真理，排除人世间一切的罪恶与祸害。我们不能与不良的环境抵抗，不能制造良好的遗传，这实在是我们的软弱呵!我以为现代的人，如果深明白遗传与环境关系的重要，应当忘记背后的，努力面前的。就不妨变更古人的话说：“一举足而不敢忘子弟”。那末，我们就必要谦卑、诚实、勇敢、勤慎地为人了。[23]
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