1909年农历六月，鲁迅从日本回国。当时他的好友许寿裳已在杭州浙江两级师范学堂担任监学（相当于今之教导主任）。经许寿裳推荐，鲁迅到该校任教，担任初级师范的化学教员和优级师范的生理卫生学教员，兼任日籍植物学教员铃木珪寿的助教，当他的课堂翻译。据许寿裳回忆：“鲁迅教书是循循善诱的，所编的讲义简明扼要，为学生所信服。”[4]
鲁迅所教的两门课程都有自编的讲义。《化学讲义》至今没有找到。《生理学讲义》原分两册，鲁迅自留的一部，封面有许寿裳题字“人生象斅”，现藏于中国国家图书馆。这个讲义由唐弢同志编入《鲁迅全集补遗续编》，于1952年出版，共248页，长达11万字。讲义内容主要是生理学、解剖学和卫生保健的知识，论证有力，文字精练，从当时的科学水平来看，科学性和系统性都很强。讲义中附有鲁迅自绘的插图72幅，附表5个，末附14项实验。它是我国近代最早的生理卫生学讲义之一，有很大的科学价值和历史价值。
在讲授时，鲁迅给学生讲解当时最先进的科学知识。讲生理学时，应学生要求，他破例地讲了生殖系统。讲之前，他给学生提出了一个条件：在讲授过程中不许笑。学生们自始至终遵守这个约定，这次讲课的效果很好。他曾对同事们说：“在这些时候，不许笑是个重要条件。因为讲的人态度是严肃的，如果有人笑，严肃的空气就破坏了。”大家都佩服他的卓见。[5]
在讲授和实验时，他鼓励学生要敢于解剖尸体。当时，一般人还缺乏现代医学知识，对尸体的解剖还很惊奇。他就给大家介绍自己学医时解剖尸体的体会。“据他说，他曾经解剖过不少的尸体，有老年的，壮年的，男的，女的。依他的经验，最初也曾感到不安，后来就不觉得什么了。”[6]
这样的讲解在当时是少见的。讲生殖系统不但是对封建礼教的挑战，而且通过讲解，传授了科学的胚胎学知识，批判了“转世轮回”的宿命论。鼓励解剖尸体，就是与“身体发肤，受之父母，不敢毁伤”的封建礼教唱反调。在被封建蒙昧笼罩着的清末，没有大无畏的革命精神和科学态度是做不到的。
在教学方法上，鲁迅力求理论联系实际，非常重视调查研究和科学实验。
在植物学的教学中，他经常带学生到野外实地观察植物的各种品种。星期六下午或星期天，他常与学生一道采集植物标本，星期天上午则经常用于制作标本，以备教学时应用。在杭州一中（其前身即浙江两级师范学堂）鲁迅纪念室中，保存着鲁迅1910年3月采集植物标本的记录。从3月1日到29日，鲁迅共外出采集12次，到过的地点有孤山、钱塘门内外、栖霞岭、灵隐山、吴山等地。该记录还记有他自己的统计：“三日所采共七十三种。”当时的一个学生蒋谦保存下来的植物标本也被陈列在纪念室里。据鲁迅当时的同事杨乃康（莘耜）回忆，鲁迅当时曾计划写一本《西湖植物志》，后来因离开杭州没有写成。
教生理学时，鲁迅注重做实验。他的《生理学讲义》末附《生理实验术要略》，列出要做的14个实验项目，包括“骨之有机及无机成分”“唾之糖化作用”“生物失空气则死”，等等。[7]这个《要略》后来经过鲁迅自己的修订，作为一篇科学实验论文，正式发表于杭州出版的《教育周报》第55期（1914年10月4日出版）。这是目前发现的鲁迅在浙江两级师范学堂任教期间唯一的一篇佚文。[8]
鲁迅教课不看讲义，侃侃而谈，讲话生动有趣，通俗易懂，容易记住，同学们对他教的课非常欢迎。
有一次鲁迅上化学课，讲硫酸。他告诉学生硫酸的腐蚀性强，若是皮肤上蘸到一点，就会感到像被蜂蜇了似的痛，大家要注意。后来分组实验时，突然有一个学生手按脖颈，连声叫痛，原来一个恶作剧的学生用竹签蘸了一点硫酸在他的后颈上点了一下，他痛得叫了起来。鲁迅马上过去给他搽药止痛，同时批评了那个恶作剧的学生。
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