武宗时期，流匪横行于各省。河北刘六、刘七兄弟作乱，从北京近郊一直蔓延至四川、江西等省，并呈现逐渐扩张的趋势，告急公文从四面八方送抵京师。由于皇帝昏庸、宦官当政、税赋繁重，加之连年洪涝、干旱频发，以致灾民遍野，百姓饱受煎熬，纷纷揭竿而起。
王阳明初到赣州时，当地贼匪活动甚为猖獗，其中有湖广、江西两省的横水、桶冈地区的谢志珊部、蓝天凤部，广东省浰头地区的池仲容部，福建省漳南道（汀州、漳州）大帽山地区的詹师富部等。他们抢掠百姓，严重扰乱社会治安，其恶劣影响已波及江西省境内。
另外，江西省南安府南部大庾岭的陈曰能也蠢蠢欲动。之前，官军数次讨伐，败多胜少，常常无功而返。正德六年（1511），都御史陈金总领军务，右副都御史俞谏为提督，来赣协助巡抚周南征剿大帽山贼匪。由于指挥不当，官军被围困于崇山峻岭之中，以致此次征剿未能根除匪患。历次剿匪所调狼达土军虽然杀敌勇猛，但对百姓危害极深，贼匪也是屡剿不灭。加之，宁王朱宸濠暗通贼匪，并为其做后盾，陈金等人对此皆无计可施。
见此情景，继任巡抚文森便称病不出，朝廷最终决定起用王阳明。其实，南赣地区在五十年前就是贼匪聚集之所，剿匪绝非一朝一夕之事。
王阳明于正德十二年（1517）正月赶赴南赣，随即开始选拣民兵，并推行“十家牌法”。仅数日之后，王阳明即调军征剿南赣贼匪。由于时间仓促，所募民兵未曾充分训练，因此不足以与匪军抗衡。尽管如此，王阳明依旧下令发兵清剿。
当时，王阳明的声名尚未远播，赣州各级官员及当地百姓也不了解王阳明其人。因此，王阳明所下指令常常难以得到彻底的贯彻执行。同时，王阳明并不确定属下将官能否拼死应战。若有上述种种不利情况，而统帅又为碌碌之辈，此战必败无疑。
但王阳明绝非庸才，善于随机应变，他亲临战场指挥作战，最终官军首战大获全胜。在这次战役中，王阳明利用罪犯、俘虏戴罪立功的心理，让他们为官府效命，这也是官军取胜的法宝之一。
虽然为了防止军情外泄，王阳明推行了“十家牌法”，但福建、广东两省仍常有官员泄露军情的情况出现。于是，王阳明要求各级官员勿将重要军情写入公文。正德十二年正月，王阳明制订了周密的作战计划，就剿匪一事下达公文《剿捕漳寇方略牌》（《王文成公全书》卷十六），此文开头写道：
为此另行牌仰广东岭东，福建汀、漳等处兵备佥事……顾应祥、胡琏，密切会同守巡纪功、赞画等官，于公文至日，便可扬言。
本院新有明文，谓：天气向暖，农务方新，兼之山路崎险，林木蓊翳。若雨水洊至，瘴露骤兴，军马深入，实亦非便。莫若于要紧地方，量留打手机兵，操练堤备。其余军马，逐渐抽回；待秋收之后，风气凉冷，然后三省会兵齐进。
同时，王阳明也下达了详细的作战指示：
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