Aβ不仅可由脑实质的神经元、胶质细胞等产生，还可由血管内皮细胞等多种细胞生成。脑实质内外的Aβ可以通过血脑屏障（bloodbrainbarrier, BBB）进行交换。Aβ主动转运跨越BBB与多种蛋白受体有关。晚期糖基化终产物受体（receptorforadvancedglycationendproducts, RAGE）使血液中的Aβ跨越BBB进入脑实质，在大脑中沉积，而AD患者脑组织内表达上调，且与疾病的严重程度及年龄相关。脑实质内的Aβ由低密度脂蛋白受体（lowdensitylipoproteinreceptorrelatedprotein, LRP）-1运输到血管内皮细胞上，再由三磷腺苷（adenosinetriphosphate, ATP）结合盒转运蛋白（ATP-bindingcassette, ABC）转运体从血管内皮细胞运输进入血液。研究表明，AD患者脑血管内皮细胞上ATP结合盒转运蛋白G2 （ABCG2）表达升高。当Aβ跨膜转运的功能障碍，影响脑实质内Aβ产生和降解失衡，通过直接神经毒性或者介导炎症反应，同样导致AD的发生。
APP在细胞内大致的分解切割途径如下：在内质网合成的APP在经过高尔基体的修饰加工后被运往细胞膜表面，在细胞膜表面的APP大部分被α-分泌酶切割，而没被切割的APP则通过其胞质尾与衔接蛋白AP2相互作用，经过网格蛋白介导的内吞重新被运回内体。运回内体的APP又会被进一步运往溶酶体或者重新被运回高尔基体并再运送到细胞膜表面。
APP在细胞内的循环通路指出，通过内吞途径进入细胞的APP会被分选到不同的细胞器内，如高尔基体、质膜、内体、溶酶体。而β-内分泌酶对APP的切割分解主要发生在内体。因此，APP是否被分选运输到内体以及在内体内驻留时间的长短对Aβ42生成起着决定性作用。在生理状态下，分选到内体的APP借助于囊泡分选蛋白-10（Vps10）家族的成员分选蛋白受体（SorLA）以及逆膜运输复合体（retromer）被逆向运输到高尔基体，除此之外，SorLA还会进一步保持APP驻留于高尔基体内，从而避免其被进一步分解切割为Aβ42。
Retromer的主要功能是介导蛋白从内体逆向运输回高尔基体，无论是新合成的蛋白还是被检索重新利用的蛋白均受其分选转运，也就是说，Retromer在整个分泌途径中扮演着分选者的角色，现研究表明Retromer在Wnt的分泌、细胞自噬的清除、磷酸水解酶的检索中都占有重要的地位。
2005年，研究者就已经发现AD患者海马区Vps35和Vps26的含量较正常人明显减少；随后的动物实验也证明将Vps26敲减会导致小鼠脑部Aβ表达增加、海马区突触功能下降，最终出现记忆的损害。这些研究都表明Retromer的功能受损对AD的疾病发生有着不可推卸的责任。由此可见APP的正常切割、运输、降解是AD的早期防线。
三、Tau蛋白学说
细胞外大量老年斑的形成及细胞内神经原纤维缠结（neurofibrillarytangles, NFTs）是AD特征的病理改变。异常过度磷酸化的Tau蛋白是NFTs最主要的成分，已有研究表明异常的Tau蛋白大量聚集于退行性病变的神经元与AD患者的病程进展呈正相关。由此可见Tau蛋白在细胞内大量聚集是导致AD患者发病并进一步促进疾病发展的关键因素。
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