所谓障者何物耶？我辈凡夫，正在障中，若不先知障之名相，云何修断。在前虽已略说，今更为详言之。障有三种：一烦恼障。二业障。三报障。烦恼障亦名惑障，即是妄想。在菩萨有无明惑，即根本无明是也，能障中道实相理谛。在二乘有尘沙惑，能障化道，谓不能通达多如尘沙之法门，而自在教化也。尘沙约法门言。若约惑体，则唯一劣慧而已。在凡夫有见思惑，即枝末无明。贪瞋痴等，由倒想起，名为思惑。身边等见，由邪见起，名为见惑。此见思惑，能障自心真空之理，能造善与不善及不动之业，能成分段生死。分段者，凡夫正报，有分段差异，《唯识论》曰“身命长短，各有定限”是也。若断见思二惑，便了生死而离三界，此即二乘所证之涅槃。又见、思惑，二乘通断，名为通惑。无明、尘沙，名为别惑。别惑虽二乘未断，至菩萨位，乃断尘沙。金刚道后，方断无明。业障者，在菩萨为二边业，即非漏非无漏业。漏者，漏落于生死轮回也。谓非如凡夫之漏于分段生死，亦非如二乘之住于偏空涅槃，即不住生死不住涅槃之意。此业能感实报庄严土。在二乘为无漏业。二乘已离分段生死，但有变易生死，故曰无漏。变易者，谓二乘圣人，色形寿命随意生灭，微细变易，亦名为意生身。是故变易本非生死，因其随意生灭，是无常法，故名为生死耳。此业能感方便有余土。在凡夫为善业，则感三善道；为恶业，则感三恶道；为不动业（即界内，禅定），则感色无色等天也。报障者，在菩萨正报为胜妙身（随类应现，神化殊妙），依报为实报土。在二乘正报为意生身，依报为方便土。在凡夫正报为五阴分段之幻身，依报为凡圣同居之秽土。业报二障中，凡夫业报，未出生死轮回，名之为障，其义易知；若菩萨二乘之业报，则因其未证佛果，未居常寂光土，故皆称为障也。
此惑业报三种障，非忏悔不能除。而真实忏悔，须念实相。欲证实相，须修止观。盖由体真止入空观，能破见思惑，空善恶不动业，了分段报；由方便随缘止入假观，能破尘沙惑，空无漏业，脱变易报；由息二边分别止入中道观，能破无明惑，融二边业，而知虚状果报，不生不灭，唯是一心，体证真如也。下“约用差别”中，明真如在障出障，由于染熏净熏，须知修习止观，即是净熏令起净用之无上法门耳。他如净土宗之念佛，不起杂念止也，字字分明观也；禅宗之看话头，不可用心意识参止也，又不可堕入无事甲里观也。岂有一法，能出止观者哉！
文中问意可知。答谓就心体言，一切平等，实无障垢与否之可说；即就性用言，虽有染净二名，实则原同一体，融成一味，并无差别。“不相妨碍”者，差即无差之意。
（未）二，明约用差别。
但就染性依熏起故，有障垢之名。此义云何？谓以染业熏于真心违性故，性依熏力，起种种染用。以此染用，违隐真如顺用之照性故，即说此违用之暗，以为能障，亦名为垢。此之垢用，不离真体故，所以即名真如心，为在障法身，亦名为有垢真如。若以净业熏于真心顺性故，性依熏力，起种种净用，能除染用之垢。以此净用，顺显真心体照之明性故，即说此顺用之照，以为圆觉大智，亦即名大净波罗蜜。然此净用，不离真体故，所以即名真心，为出障法身，亦名无垢真如。以是义故，若总据一切凡圣，以论出障在障之义，即真如法身，于一时中并具在障出障二用；若别据一一凡圣，以论在障出障之义，即真如法身，始终方具在障出障二事也。
初中句，“染性”二字，宜依宗圆记，改作“二性”，或作“染净”，于文相方合。因其下“此义云何”句，是承上启下。而下文则兼明染净。由此例知此句，必为总标之词也。
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