海水从地中海大量外流，导致了全球海平面的升高。地中海原先的岛屿变成山脉，河水毫无意义地流入山谷深处强烈蒸发的咸水湖中，这片山谷地区最深处位于海平面以下4000米处。这是当时全世界陆地的最低点。空气越来越重地朝着深谷处下沉，风沿着悬崖向下吹。当一个气团向下运动时，气压就会升高。就像在一台发动的引擎当中，不断增加的压力使气体压缩并升温。风每向下吹1000米，温度就上升大约10摄氏度。当时的地球处在寒冷时期，但尽管如此，这片平原位于地表之下4000米的最低处的夏季最高温度仍可以达到恐怖的80摄氏度——这比现代美国加州死亡谷[13]所记录的最高温度还要高大约25摄氏度。中新世末期地中海洋盆的底部完全被盐覆盖，距地表3000米处以下区域全是亮晶晶的石膏和氯化钠，总量超过100万立方千米。只有极端环境微生物才能在这地中海峡谷的底部生存，这类微生物可以在其他生物无法存活的地方大量生长。
对人类来说，地中海的海水是连结欧洲、亚洲和非洲文化的桥梁，三大洲各个城市和文明之间通过地中海进行的交流和贸易往来，远比陆地途径便捷。然而，对于人类这样居住在陆地上的动物来说，海洋仍然是一道障碍。尽管海洋并不是一道完全不可逾越的天险，却起着延缓人类迁徙以及隔离不同人群交流的作用。在陆地上，即使是非常辽阔的险恶地带（如沙漠），在上述阻隔作用上也远远不如海洋。岛屿是海底山脉的最高峰露出水面而形成，当一片海域开始消退时，这些山峰之间相对较高的山脊也逐渐露出水面，使原先散落的各个小岛上的生态系统彼此相连。巴利阿里群岛（包括马约卡岛、梅诺卡岛、伊比萨岛和福门特拉岛等）海面以下1000米深处的海底便是一片平原，该平原连接着巴利阿里群岛的各个小岛，西连西班牙大陆，北接法国和罗讷河谷水系。撒丁岛和科西嘉岛以同样的方式与意大利北部相连接。而西西里岛和马耳他岛坐落于一条隆起的海底山脊上，这片海底连接着非洲和欧洲，隆升形成了亚平宁半岛。中新世末期的希腊岛弧，从克里克岛到罗德岛均未隆起至现代的高度，后来的塞浦路斯在当时是由火山形成的一片绝世而独立的高原台地。
在中新世末期的加尔加诺地区，远古的石灰岩山脉从意大利山脊中分离出来，如同一座孤零零的石灰石瞭望塔一般，凝视着亚得里亚海上方的天空。直至今日，这一带仍是一座孤悬于欧洲大陆之外的岛屿。岛屿上的生物在与世隔绝中演化着，出现了体型极小和极大的物种，造就了独特的生态环境，随时都有灭亡的危险。在地中海消失之前的数百万年里，加尔加诺绝大部分时间里都是一个岛屿，在极少数情况下与邻近的斯康特伦相连。随着地中海逐渐消退，海峡消失，岛屿与大陆连接起来。大量海域的消失意味着没有足够的水汽蒸腾形成降雨，这片原本水土丰美、生机盎然的地区将变得越来越干旱。尽管河流在合适的季节也会流经此处，但没有湖泊和大量的蓄水，降雨也无从谈起。雪松伸展着枝条，遮蔽着光秃秃的山坡，塌了秧的山毒芹挂着绿色的顶穗在深谷中勉强维持着生存。降雨量的减少不利于针叶林木的生存，干旱的岩石和**的地面更适合一些灌木，如黄连木、黄杨、盘曲的角豆树和凹凸不平的橄榄树，这些都是干旱环境中造就的植被。
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