6月25日，发现无法挽回败局的巴甫洛夫对西方面军的4个集团军下达了全线撤退的军令，他准许各集团军充分征用各种交通工具，要求部队日夜赶路，在广阔的大地上甩掉德军。然而，西方面军的各个部队已经被呼啸而来的德机群和快速推进的装甲集群撕得支离破碎。苏军既没有燃油又缺少交通工具。在比亚韦斯托克和诺沃格鲁多克之间的大“口袋”中，苏军二十几个师已经被困住了。
6月26日，斯大林发电报给远在加利西亚的苏军总参谋长朱可夫，要求他立即返回莫斯科，有更重要的任务要交给他。这一天，德军古德里安的第2装甲集群进抵明斯克附近，同苏军第13集团军展开了激战。中午，霍特的第3装甲集群出现在明斯克以北，距离明斯克只有29千米。那天下午，包克接到了陆军司令布劳希奇关于扎紧口袋的电令。包克虽然不愿意，但也只能下令：“古德里安将向东挺进的大部分兵力北调，在明斯克与霍特会师，扎紧口袋。可准许第24装甲军向别烈津纳河岸的博勃鲁伊斯克和第聂伯河畔的罗加切夫发起试探性攻击。”，和包克一样，古德里安和霍特也不同意最高统帅部的命令，但他们必须执行。他们还想前进，在322千米外的斯摩棱斯克扎紧口袋。
德军坦克行驶在明斯克城外。
德国陆军参谋长哈尔德满腔怨气地说，因希特勒的无端干预，陆军司令布劳希奇被迫放弃了正确的大胆东进，结果德军向博勃鲁伊斯克的推进只能算是一次武力试探。哈尔德认为古德里安敢于采取正确的军事行动——在莫吉廖夫和罗加切夫继续强渡第聂伯河，扑向斯摩棱斯克。可见，德军陆军部因害怕希特勒不敢发出这种命令，却指望古德里安抗命。
6月26日下午，南路的古德里安、北路的霍特两路装甲集群在明斯克附近会合。德国空军元帅凯塞林指挥第2航空队的近千架飞机疯狂地轰炸扫射苏军。
6月27日，苏德战争爆发的第5天，德军第2和第3装甲集群展开猛攻。苏军22个步兵师和近7个坦克师、6个机械化旅的兵力，在明斯克—比亚韦斯托克地区遭到重创。
6月27日10时零5分，朱可夫根据斯大林的最新指示，通过电报向巴甫洛夫传达统帅部的命令：“要求西方面军司令部立即找到所属的部队，跟各个部队的指挥官联系上。司令部将向指挥官们说明情况，给部队提供作战的必需品，查清需要给哪些部队空运燃料和弹药，避免部队丢弃贵重兵器，尤其是重型坦克和重炮。命令留在德军后方的部队，根据3个不同的方向集中突围。提请西方面军司令部注意，德军机械化第一梯队已经脱离德国步兵部队很远，这是德军的弱点，若能对德军机械化部队进行夜间反击，可望取得胜利。”然而西方面军所有阵地的形势仍在恶化，被合围的苏军在极端困难的条件下向东南方向突围。在苏军的坦克、重炮的掩护下，骑兵部队、步兵部队进行了无数次集团冲锋。许多官兵侥幸冲出了包围，开始了游击战，但大部分苏军在突围中丧生。
傍晚，苏军被赶出明斯克。德军进入明斯克后，对城内居民展开了野蛮的大屠杀，大半个城市被德军炸毁。苏军西方面军遭到灭顶之灾。德军中央集群通向莫斯科的大门敞开了。
斯大林杀一儆百
1941年6月30日，斯大林从德国广播电台中收听到苏联西方面军被围歼的消息，马上打电话要求朱可夫通过电报与巴甫洛夫联络，询问德国广播的消息是否可信。当朱可夫问巴甫洛夫时，他竟对战场的情况不甚了解。朱可夫继续问巴甫洛夫：“那么德国的广播报道是不是真的？”巴甫洛夫说：“应该是真的。”通过身边发生的事情，巴甫洛夫明白了问题的严重性，他无奈地接受了这一事实。德军的推进速度惊人，巴甫洛夫直到这时才体会到德军装甲集群的强大威力，他为战前自己对坦克的轻蔑态度后悔不已。
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